La historia de la Prefectura Quequén se remonta al año 1898, cuando, por decreto de ese mismo año, se estableció la creación de la "Subprefectura del Puerto de Quequén Grande". Bajo el liderazgo del señor Carlos B. Santos, quien fue designado como el primer titular con el cargo público de Ayudante Primero, la institución comenzó a desempeñar un papel fundamental en la seguridad marítima y portuaria de la región.

La relevancia estratégica del Puerto Quequén, sumada a las características únicas de su jurisdicción, impulsó a la Prefectura a dotarse de personal y medios operativos adecuados para cumplir una amplia gama de funciones. Desde la seguridad de la navegación hasta la protección del medio ambiente marino, pasando por la vigilancia de los espacios portuarios y la preservación del orden público, la Prefectura Quequén ha sido clave en garantizar la seguridad y el bienestar de la comunidad durante más de un siglo.

A lo largo de los años, el personal de la Prefectura Quequén ha mantenido vivo el legado de sus pioneros, demostrando un profundo compromiso, lealtad y pasión por su labor. Enfrentando desafíos y adversidades, continúan trabajando con dedicación para asegurar la protección de Puerto Quequén y sus alrededores.